Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calr3Q9D9Q6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms