Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp12Q9D9M2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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