Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms