Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8N1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms