Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms