Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms