Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D7E4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms