Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms