Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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