Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Borcs6Q9D6W8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Borcs6Q9D6W8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Borcs6Q9D6W8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs6Q9D6W8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms