Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms