Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt34Q9D646 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms