Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms