Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PudpQ9D5U5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms