Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D4W2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D4W2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D4W2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms