Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syce1Q9D495 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms