Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms