Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox1Q9D350 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms