Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf128Q9D304 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf128Q9D304 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms