Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim42Q9D2H5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim42Q9D2H5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim42Q9D2H5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim42Q9D2H5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim42Q9D2H5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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