Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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