Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd3Q9D176 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms