Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ifitm1Q9D103 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ifitm1Q9D103 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ifitm1Q9D103 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm1Q9D103 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms