Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfc5Q9D0F6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfc5Q9D0F6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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