Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndc80Q9D0F1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndc80Q9D0F1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms