Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mms19Q9D071 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms