Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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