Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx7Q9CY18 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms