Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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