Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RpainQ9CWY9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RpainQ9CWY9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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RpainQ9CWY9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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