Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms