Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms