Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm3Q9CQW9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms