Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms