Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl35Q9CQL6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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