Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms