Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms