Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms