Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms