Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms