Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms