Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Chmp3Q9CQ10 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms