Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms