Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Sike1Q9CPR7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sike1Q9CPR7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sike1Q9CPR7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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