Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms