Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn6Q99PL6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms