Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrbp1Q99PL5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms