Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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