Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms