Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms